Deux biobanques pour lutter contre la COVID-19
Face à la pandémie de COVID-19, deux biobanques ont rapidement été mises sur pied pour faciliter la recherche.
Comment en apprendre davantage sur le virus SARS-CoV-2 et ses impacts sur la santé humaine? En recueillant le plus de données possible! Des équipes observent de près des milliers de spécimens du virus ou fouillent le génome de personnes infectées. Au Québec, deux biobanques ont été créées pour pouvoir recueillir et analyser tous ces échantillons de volontaires (on s’assure de la vie privée en dé-identifiant ceux-ci). Les chercheurs peuvent ensuite accéder à cette collection à des fins de recherche.
La biobanque CoVBanQ contenant les souches virales
Née d’un partenariat entre le Laboratoire de santé publique du Québec et le Centre de génomique de McGill, la biobanque CoVBanQ contient les données liées au virus. «Les hôpitaux québécois nous envoient un échantillon de tous leurs cas positifs», explique Sandrine Moreira, responsable des développements génomiques de l’Institut national de santé publique du Québec.
En procédant au séquençage génétique et à l’analyse bioinformatique de ces échantillons, les chercheurs veulent dresser un portrait de l’évolution du virus et de sa transmission au sein de la population. À terme, l’équipe scientifique vise le séquençage d’au moins 50 000 échantillons en les analysant au rythme de 1 500 par semaine.
Jusqu’à présent, les premiers milliers ont été séquencés. «Cela nous a pris plus de temps que prévu pour mettre en place tous les outils pour l’analyse», indique-t-elle. L’équipe de recherche n’avait pas l’habitude de travailler sur un nombre élevé d’échantillons. Pour accélérer la cadence, des robots ont été greffés à la chaîne de production. «Cela prend du temps pour les programmer et surtout pour vérifier qu’ils fonctionnent correctement. On ne voudrait pas mélanger des échantillons.»